Cell Line Synopsis
Cell Line Overview
Mutations
Copy Number Variation
Gene Expression
RNAi
Compound Sensitivity Profile
Similar Cell Lines

NB10 - Copy Number Variation - Cell Line Synopsis

External Data Sources:COSMIC - Cell Lines Project
Genome Average Copy Number: 3.39

Regions

Chromosome Genome Start Genome Stop Copy Number Signal
Y23766155241197801loss
Y15052798153044260loss
Y747222375569800loss
Y890271490466060loss
Y949679795257450loss
Y724997873264110loss
Y764282376531390loss
Y20804422208363680loss
674592225745973420loss
Y21159055212014240loss
Y21433500215423800loss
172756114727633710loss
Y567231556777200loss
1338072037380847580loss
Y867984388332260loss
Y964855196951870loss
Y14628509146469300loss
Y15683793158184090loss
1739423015394305321loss
1838260435382653900loss
Y602903161013810loss
Y58976953589775230loss
Y19033697190548890loss
Y683463668777310loss
Y24349164244357940loss
Y20694292207390800loss
1718358950184645870loss
Y16243588163922630loss
11113773691113882270loss
11041635001042612070loss
Y421769042509370loss
Y20382318203977100loss
Y18596847186340790loss
1233301407333073750loss
Y14081273141832960loss
Y19435858196176661loss
Y907841891001470loss
Y14252193143574410loss
Y16713318167738700loss
Y18102800181195410loss
346801818468491800loss
Y819700683733841loss
Y15311544156829511loss
Y24740870248850430loss
Y581797058956490loss
Y23412068236531990loss
12403940162403941400loss
Y19854165198960400loss
389394593894193821loss
Y22971190230582020loss
Y22866703229475890loss
X29727841298301591loss
X96576902967363021loss
Y408400141708070loss
Y455376946709250loss
Y664733267671000loss
Y802887781944370loss
Y14785989150522251loss
Y15875833161158551loss
Y16992932172061910loss
Y17764242177919840loss
Y18368245184088830loss
1678735339787731011loss
1729457747295861550loss
1058516376585257431loss
1255555614556562151loss
1323632679236335020loss
Y19162759194318980loss
Y21769434218075700loss
Y21808681228658451loss
Y28517126285828650loss
71047873491049721741loss
8456652146259251loss
936993071386828851loss
939140233398023231loss
110566148105855270loss

Genes

Ensembl Gene Gene Name(s) Copy Number Signal Chromosome Start Stop Strand
ENSG000002133611loss71048850991048854171
ENSG00000244490RWDD4P11loss71049419691049425331
ENSG000002379681lossY24086159240877401
ENSG00000188399ANKRD36P10lossY28555962285666821
ENSG000002234220lossY754694075490691
ENSG000002282070lossY87692448771317-1
ENSG00000224408USP9YP220lossY902130390234121
ENSG00000228411CDY4P1lossY1491390614915763-1
ENSG000002235170lossY1638809216389369-1
ENSG00000227949CYCSP460lossY1705342717053630-1
ENSG00000249606TRAPPC2P70lossY2081740620818076-1
ENSG00000242153OFD1P6Y0lossY20835919209010831
ENSG00000012817KDM5D1lossY2186575121906825-1
ENSG00000237269RBMY2TP0lossY2359258323599131-1
ENSG000002357190lossY2362727023629049-1
ENSG00000226042CDY10P1lossY2379936123800927-1
ENSG000002516181lossY24041541240437061
ENSG00000226092RBMY2AP1lossY2407366824083297-1
ENSG00000229351KRTAP9-11P1loss1739427563394280871
ENSG000002663710loss1729460200294655361
ENSG00000154874CCDC144B0loss171844111718528930-1
ENSG00000237763AMY1A0loss11041979121042071731
ENSG00000236256DIAPH2-AS11lossX9668628596897588-1
ENSG000002160701loss93729602037296101-1
ENSG000001879881loss937477146374783141
ENSG000002569661loss93751254437592466-1
ENSG00000233111RAB1C1loss93763668537637290-1
ENSG00000201287RN7SKP1711loss93766174437662046-1
ENSG00000226055PAICSP11loss937878113378794901
ENSG000002237161loss938360424383764271
ENSG00000237487VN1R48P1loss93850444438505479-1
ENSG000002415361loss939485380394858661
ENSG000002269180lossY23473154234807811
ENSG00000223637RBMY2EP0lossY2355687723563471-1
ENSG00000229416USP9YP81lossY2383913223843004-1
ENSG000001733570lossY877426587841141
ENSG00000235462TAB3P10lossY1526584215274125-1
ENSG000002526940lossY1577984015779936-1
ENSG00000183878UTY1lossY1536025915592553-1
ENSG000002662200lossY1636406516364171-1
ENSG000002651970lossY1839812718398238-1
ENSG00000250951USP9YP10lossY20702866207060141
ENSG00000235479RAB9AP40lossY20811557208121651
ENSG00000234529GAPDHP190lossY21489455214904591
ENSG000002601971lossY2185382721856492-1
ENSG00000198692EIF1AY1lossY22737611227550401
ENSG00000225624TBL1YP10lossY22889140229047861
ENSG00000265260RN7SL74P1lossX96596045965963411
ENSG000002508501loss937002694370080371
ENSG000001253851loss937046832370472341
ENSG000002331371loss937079893370903981
ENSG000002005021loss937160134371602341
ENSG000002246481loss93738317537384431-1
ENSG00000137106GRHPR1loss937422663374369871
ENSG000002301881loss93749041837490890-1
ENSG000002341601loss937509147375102961
ENSG00000165275TRMT10B1loss937753804377789691
ENSG00000107371EXOSC31loss93776697537801434-1
ENSG000002138391loss937885680378863871
ENSG00000107338SHB1loss93791913138069210-1
ENSG000002000261loss938147425381475581
ENSG000002151651loss938478468384793471
ENSG000002295111loss93848685638488335-1
ENSG000002729041loss93854247638568419-1
ENSG00000225345SNX18P31loss93856625738568208-1
ENSG000002375571loss938643039386437651
ENSG00000252725RNU6-765P1loss938680003386801011
ENSG00000264912RN7SL640P1loss939191097391913551
ENSG000002237581loss93936837639368790-1
ENSG000002688191loss939631025396323951
ENSG000002493361loss93972243239817308-1
ENSG00000197706OR6C741loss1255640982556420861
ENSG00000227408AMYP10loss11042563451042624931
ENSG00000122741DCAF101loss937800499378676631
ENSG000002730361loss93854056438542762-1
ENSG00000259898CYP4F33P1loss93854231138542566-1
ENSG000001984161loss93944380439464526-1
ENSG00000225995ATP5A1P91loss93965419839655518-1
ENSG000002329201loss93707352837075789-1
ENSG000002067841loss937322256373223681
ENSG00000147912FBXO101loss93751088937588871-1
ENSG000002707641loss71048296371048302611
ENSG00000157828RPS4Y20lossY22918050229429181
ENSG00000225878SERBP1P20lossY46697264670889-1
ENSG00000233634GOT2P50lossY670574867062931
ENSG00000238073RBMY2HP0lossY75397847544065-1
ENSG00000234850MTND2P31lossY824028282407511
ENSG000002283790lossY965092496551221
ENSG00000229208RBMY2NP0lossY96690279684305-1
ENSG000002245180lossY17053626170545951
ENSG00000172468HSFY10lossY20708557207508491
ENSG00000252766RNU6-255P0lossY2118086921180973-1
ENSG00000228764ZNF885P1lossY22551937225586821
ENSG00000230662TNPO1P20loss1718363705183663691
ENSG00000224634ZNF736P6Y1lossY821897282201841
ENSG00000216824ZNF736P10Y1lossY82868328287941-1
ENSG00000232235CDY3P0lossY90036949005311-1
ENSG000002326170lossY950283895066191
ENSG00000114374USP9Y1lossY14813160149727641
ENSG00000067048DDX3Y1lossY15016019150323901
ENSG00000215414PSMA6P11lossY15398518153992581
ENSG00000129864VCY1lossY1609765216098393-1
ENSG00000154620TMSB4Y0lossY15815447158179041
ENSG00000228518SURF6P10lossY19304706193055321
ENSG00000224989FAM41AY11lossY19612838196268981
ENSG00000237997RCC2P21lossY2214846122149738-1
ENSG00000232522ZNF886P1lossY2216307122174090-1
ENSG00000229551GAPDHP170lossY23023223230242231
ENSG00000183146CYorf170lossY2354484023548246-1
ENSG00000169849TSPY14P0lossY23630044236325691
ENSG000002297251lossY24017478240196971
ENSG000002249170lossY2481676324819006-1
ENSG00000099721AMELY0lossY67339596742068-1
ENSG00000252472RNU6-521P0lossY72910957291199-1
ENSG000002730180loss171841453518455019-1
ENSG00000227689SRP68P20loss1718430871184317751
ENSG000002344410loss1104210693104210890-1
ENSG00000174876AMY1B0loss1104230037104239302-1
ENSG00000229236TTTY101lossY2262755422681114-1
ENSG000002168440lossY2300514223005596-1
ENSG00000233843CYCSP480lossY28546758285473771
ENSG00000236435TSPY12P0lossY75557807557589-1
ENSG00000225809RBMY2KP0lossY81324908145229-1
ENSG00000226529MTND1P11lossY823970482400711
ENSG00000224035SFPQP10lossY15195704152077191
ENSG00000229129ACTG1P20lossY1986888119870005-1
ENSG000002508680lossY1988086219889280-1
ENSG00000223555USP9YP230lossY19894090198966951
ENSG00000233327USP32P20loss171841457618429244-1
ENSG00000171916LGALS9C0loss1718380051183982591
ENSG00000236156CHCHD4P31loss937434174374345831
ENSG000002601001loss93707881037079773-1
ENSG000002558721loss93758841038068684-1
ENSG00000264255RN7SL463P1loss93745939237459706-1
ENSG00000137142IGFBPL11loss93840899138424444-1
ENSG000002383131loss938190404381905041
ENSG00000251745RNU7-124P1loss93793670437936765-1
ENSG000002509891loss93854310138543443-1
ENSG000002302811loss93965189739652392-1
ENSG00000204849SPATA31A11loss939355699393619561
ENSG00000179919OR10A71loss1255614809556157591
ENSG000002332421loss93711254537115487-1
ENSG00000137054POLR1E1loss937485932375036941
ENSG00000147905ZCCHC71loss937120536373581461
ENSG00000122696SLC25A511loss93787940037904350-1
ENSG000002729341loss93854238638543212-1
ENSG000002731701loss93854056638577204-1
ENSG00000204860FAM201A1loss938620471386249871
ENSG000002240381loss93938450339405302-1
ENSG00000266087RN7SL462P1loss939720399397206571
ENSG000002311401loss93939573439397403-1
ENSG000002421541loss71049447241049470891
ENSG000002692911lossY15418467154291811
ENSG00000226555AGKP10lossY16750976167522381
ENSG00000242389RBMY1E1lossY2402622324064214-1
ENSG00000271123TCEB1P51lossY2379356923793901-1
ENSG000002366150lossY23567656235678811
ENSG00000244395RBMY1D1lossY2402622324040673-1
ENSG000002274441lossY24065082240672531
ENSG00000231159OFD1P8Y1lossY24118460241514961
ENSG00000224657RBMY2BP0lossY24795392248050251
ENSG00000215601TSPY24P0lossY814823981502501
ENSG00000227830TRIM60P3Y1lossY82810788282095-1
ENSG00000234059CASKP11lossY1504207515060090-1
ENSG000002380130loss346839613468398801
ENSG000002282921loss93720510937205365-1
ENSG00000168795ZBTB51loss93743811137465396-1
ENSG00000175768TOMM51loss93758264337592639-1
ENSG00000137124ALDH1B11loss938392661383986581
ENSG000002430851loss938526828385270291
ENSG000002436951loss93917379139174510-1
ENSG00000215112FAM74A51loss939371062393769131
ENSG000002255291loss93972243039817308-1
ENSG00000227423OR10U1P1loss125558766655588570-1
ENSG00000070601FRMPD11loss937650997377469011
ENSG000002324541loss937836041378363911
ENSG00000176007FAM220BP1loss938527094385279091
ENSG000002252541loss93845277938454067-1
ENSG00000180071ANKRD18A1loss93854056638620657-1
ENSG000002714541loss939159068391603161
ENSG000002266251loss939154072391554761
ENSG000002714821loss71048450471048453061
ENSG00000223955MTND6P11lossY82315778232000-1
ENSG00000238154USP9YP40lossY90272389042220-1
ENSG00000234179MTCYBP11lossY823207382331911
ENSG00000223915DPPA2P11lossY15342765153433201
ENSG00000236131MED13P10lossY17019778170199481
ENSG00000271595TCEB1P351lossY1957675919577094-1
ENSG00000237023USP9YP31lossY23823812238358941
ENSG00000230029CDY11P1lossY23858456238601061
ENSG00000229234RBMY1KP0lossY24355478243627271
ENSG00000167494NOS2P20loss171840088618404348-1
ENSG00000213077FAM106A0loss171842788018430160-1