Cell Line Synopsis
Cell Line Overview
Mutations
Copy Number Variation
Gene Expression
RNAi
Compound Sensitivity Profile
Similar Cell Lines

COLO-741 - Copy Number Variation - Cell Line Synopsis

External Data Sources:COSMIC - Cell Lines Project
Genome Average Copy Number: 4.76

Regions

Chromosome Genome Start Genome Stop Copy Number Signal
17394230153943053210gain
316251315016262660411gain
21157135441571354414gain
6806628694879339gain
613571801150926659gain
6150942271663305610gain
616633925200360429gain
6220154812353110810gain
623533622240106769gain
15271147532711475312gain
289133632893554479gain

Genes

Ensembl Gene Gene Name(s) Copy Number Signal Chromosome Start Stop Strand
ENSG00000241755IGKV1-99gain28930947989310012-1
ENSG00000239855IGKV1-69gain28926578189266286-1
ENSG00000251164HULC9gain6865237086540791
ENSG000002271169gain61973065819734798-1
ENSG000002189769gain61836696718368875-1
ENSG00000165097KDM1B9gain618155560182240841
ENSG00000184612RPL7P269gain61753113017531883-1
ENSG0000020719310gain61623246216232561-1
ENSG00000235488JARID2-AS110gain61524804615248865-1
ENSG000002342619gain61497701915090234-1
ENSG000002373469gain61439146214393519-1
ENSG00000180537RNF1829gain613924677139805331
ENSG000002722099gain613825663138268051
ENSG000002330759gain613817713138179661
ENSG00000010017RANBP99gain61362173013711796-1
ENSG0000026156810gain622221010222226241
ENSG00000201415RNA5SP2049gain61772201717722134-1
ENSG000002723419gain616764577167671141
ENSG00000216364MRPL42P210gain616171837161722621
ENSG00000008083JARID210gain615246527155222521
ENSG00000124523SIRT59gain613574816136147901
ENSG000002347639gain683421708343254-1
ENSG00000218512SPTLC1P29gain62385692623857046-1
ENSG000002284129gain61980239519804983-1
ENSG000002374049gain61969005619753344-1
ENSG00000201523RNA5SP2059gain619438514194386491
ENSG00000218643RPL5P209gain619348412193493071
ENSG000002722699gain617706488177075751
ENSG00000230873STMND19gain617102489171316031
ENSG00000263712MIR463910gain616141787161418551
ENSG00000201519RNU6-645P10gain61532459815324703-1
ENSG000002296469gain61459774514599921-1
ENSG000002306319gain61423000614231801-1
ENSG000002257759gain691244549162010-1
ENSG000002309399gain6878441187856781
ENSG00000124802EEF1E19gain680735938102811-1
ENSG00000219582HNRNPA1P589gain624002052240026581
ENSG000002194539gain623649724236500021
ENSG00000112273HDGFL110gain622569678225718921
ENSG00000214012KRT18P389gain619612986196142671
ENSG00000124795DEK9gain61822409918265054-1
ENSG000002035189gain617894075178943001
ENSG000002299319gain616761369167628831
ENSG00000124788ATXN110gain61629934316761722-1
ENSG0000021807310gain616161157161616421
ENSG00000242989RN7SL332P10gain615113199151134501
ENSG00000206960RNU6-793P9gain614646766146468691
ENSG00000238987RNU7-133P9gain614156693141567541
ENSG00000050393MCUR19gain61378678913814800-1
ENSG00000124786SLC35B39gain684133018435794-1
ENSG000002322349gain6832988883426881
ENSG00000197794IGKV7-39gain28921459789214894-1
ENSG00000241351IGKV3-119gain28932666889327228-1
ENSG00000225136PGBD4P59gain28922184489222269-1
ENSG00000211593IGKJ59gain28916008089160117-1
ENSG00000211592IGKC9gain28915667489157196-1
ENSG00000253497IGKV1-139gain28934549289345963-1
ENSG00000240671IGKV1-89gain28929192889292450-1
ENSG00000243466IGKV1-59gain28924681989247475-1
ENSG00000253435IGKV2-49gain28923118489231898-1
ENSG00000211597IGKJ19gain28916139889161435-1
ENSG00000211596IGKJ29gain28916103789161074-1
ENSG00000211598IGKV4-19gain289184913891856691
ENSG00000207394RNU6-1060P10gain62312520923125315-1
ENSG0000021847610gain623102908231037741
ENSG00000260455CASC1410gain62213518622147422-1
ENSG00000222515RN7SKP24010gain622085773220861471
ENSG00000172201ID49gain619837617198409151
ENSG000002267869gain61953517519839311-1
ENSG00000207775MIR548A19gain618572015185721111
ENSG00000137393RNF144B9gain618368779184691051
ENSG000001997159gain61827339618273497-1
ENSG00000206881RNU6-190P9gain617619764176198651
ENSG00000251831RNU6-1114P10gain616205245162053511
ENSG00000214027ARPC3P510gain615935013159355461
ENSG00000047579DTNBP110gain61552303215663289-1
ENSG0000021675410gain61510317715104361-1
ENSG00000226673LINC011089gain61428035814285376-1
ENSG000002680599gain61361572813621126-1
ENSG00000225921NOL79gain613615559136329711
ENSG0000023335810gain62274462423032009-1
ENSG00000172179PRL10gain62228748022297730-1
ENSG0000026004910gain622260653223180271
ENSG0000021940410gain62221353522214466-1
ENSG00000217314UQCRFS1P39gain61963827119639039-1
ENSG000002316629gain61929055019321252-1
ENSG000002173799gain619143926191443911
ENSG000002014429gain61773768917737790-1
ENSG00000137414FAM8A19gain617600586176119501
ENSG00000218359SUMO2P139gain617582265175825361
ENSG00000112186CAP29gain617393447175580231
ENSG00000137198GMPR10gain616238811162957801
ENSG0000025179310gain61614851816148676-1
ENSG00000007944MYLIP10gain616129356161484791
ENSG0000023294710gain615995175160000281
ENSG00000201367RNU6-522P10gain615315151153152571
ENSG0000027188810gain61524415415245231-1
ENSG000002345409gain614394557144045201
ENSG00000220868MRPL35P19gain613949326139498971
ENSG00000252966RNU7-91P9gain613680312136803731
ENSG00000253278IGKV2-109gain28931948989320183-1
ENSG00000243063IGKV3-79gain28927798789278600-1
ENSG00000211594IGKJ49gain28916039889160434-1
ENSG000002207489gain623972107239731691
ENSG0000023574310gain623337939233467881
ENSG0000022877210gain62258936622594062-1
ENSG00000200957RNU6-801P9gain61964265619642760-1
ENSG000002384589gain61840218218402283-1
ENSG000002174149gain61836364818365654-1
ENSG00000200681RNU6-263P9gain61830720418307310-1
ENSG00000137364TPMT9gain61812854218155305-1
ENSG00000187566NHLRC19gain61812071818122851-1
ENSG000002209209gain617953803179541611
ENSG00000137177KIF13A9gain61775941417987854-1
ENSG00000124789NUP1539gain61761526917706656-1
ENSG000002193149gain617381598173823511
ENSG00000112183RBM249gain617281577172941061
ENSG0000026564210gain61642867516428754-1
ENSG0000021707810gain61616360816163993-1
ENSG0000021758510gain616107853161088241
ENSG0000026468710gain61514993015150030-1
ENSG00000112149CD839gain614117872141371491
ENSG000002339819gain614005151140071321
ENSG000002610719gain61361434313615387-1
ENSG00000229351KRTAP9-11P10gain1739427563394280871
ENSG00000243290IGKV1-129gain28933972189340242-1
ENSG00000211599IGKV5-29gain289196748891973001
ENSG00000211595IGKJ39gain28916073389160770-1