Cell Line Synopsis
Cell Line Overview
Mutations
Copy Number Variation
Gene Expression
RNAi
Compound Sensitivity Profile
Similar Cell Lines

CESS - Copy Number Variation - Cell Line Synopsis

External Data Sources:COSMIC - Cell Lines Project
Genome Average Copy Number: 2

Regions

Chromosome Genome Start Genome Stop Copy Number Signal
Y23766155241197800loss
289133632894953810loss
Y863108388332260loss
Y17051679173164920loss
Y21433500215523230loss
678969066790351860loss
Y21161231212014240loss
Y59001773590021020loss
Y22914302229475890loss
Y22973022230582020loss
Y836479683733840loss
Y23412068236532430loss
Y606053361013810loss
Y939219694654120loss
Y14595157147490950loss
Y977521298451980loss
Y26152734261710400loss
Y24349164245280570loss
Y58976953589770870loss
Y889643191314500loss
Y14109585143574410loss
Y16222446164159160loss
839235604393890160loss
Y850223685671880loss
X1278652091279151690loss
Y726410475854400loss
Y16561036167605490loss
Y18824278196176660loss
Y28463527285578030loss
141064299691066224410loss
2223099173232555560loss
X21297561217358800loss
X36708790370419820loss

Genes

Ensembl Gene Gene Name(s) Copy Number Signal Chromosome Start Stop Strand
ENSG000002379680lossY24086159240877401
ENSG00000226092RBMY2AP0lossY2407366824083297-1
ENSG000002516180lossY24041541240437061
ENSG00000226042CDY10P0lossY2379936123800927-1
ENSG000002357190lossY2362727023629049-1
ENSG00000237269RBMY2TP0lossY2359258323599131-1
ENSG00000188399ANKRD36P10lossY28555962285666821
ENSG00000232924TCEB1P40lossY906852490688561
ENSG00000224408USP9YP220lossY902130390234121
ENSG000002282070lossY87692448771317-1
ENSG00000234795RFTN1P10lossY75810267677302-1
ENSG000002234220lossY754694075490691
ENSG00000227949CYCSP460lossY1705342717053630-1
ENSG000002235170lossY1638809216389369-1
ENSG00000234110TSPY25P0lossY946179294639611
ENSG00000241294IGKV2-240loss28947581289476644-1
ENSG00000243290IGKV1-120loss28933972189340242-1
ENSG00000211599IGKV5-20loss289196748891973001
ENSG00000211595IGKJ30loss28916073389160770-1
ENSG00000211679IGLC30loss2223248512232489731
ENSG00000211677IGLC20loss2223243156232436171
ENSG000002648240loss2223228447232285591
ENSG00000211668IGLV2-110loss2223134980231354961
ENSG00000211666IGLV2-140loss2223101189231017071
ENSG00000185915KLHL340lossX2167360921676448-1
ENSG00000253709IGHV1-140loss14106602580106602820-1
ENSG00000211942IGHV3-130loss14106586137106586667-1
ENSG00000197475ADAM3A0loss83930856439380371-1
ENSG000002269180lossY23473154234807811
ENSG00000234529GAPDHP190lossY21489455214904591
ENSG000001733570lossY877426587841141
ENSG00000233774MED14P10lossY1473091514746333-1
ENSG00000231436RBMY3AP0lossY94481809458885-1
ENSG000002662200lossY1636406516364171-1
ENSG00000229416USP9YP80lossY2383913223843004-1
ENSG00000223637RBMY2EP0lossY2355687723563471-1
ENSG00000253278IGKV2-100loss28931948989320183-1
ENSG00000243063IGKV3-70loss28927798789278600-1
ENSG00000211594IGKJ40loss28916039889160434-1
ENSG00000211611IGKV6-210loss28945923589459850-1
ENSG000002668220lossX21581190215812811
ENSG000002355100lossX36975986369762121
ENSG00000231913RARRES2P30lossX2143994021440412-1
ENSG00000211936IGHV4-40loss14106478110106478603-1
ENSG00000253780IGHVIII-2-10loss14106467677106467967-1
ENSG00000211934IGHV1-20loss14106452671106453170-1
ENSG00000233988ADAM60loss14106435819106438358-1
ENSG00000211939IGHV1-80loss14106539079106539577-1
ENSG00000253763IGHV3-60loss14106511782106512231-1
ENSG00000211675IGLC10loss2223237555232380141
ENSG00000253590IGLV3-130loss2223104787231050091
ENSG000002078350loss2223101185231012791
ENSG000002237230lossX3698026936981498-1
ENSG00000254117IGHV2-100loss14106559546106559975-1
ENSG00000254053IGHVIII-5-20loss14106501831106502091-1
ENSG00000211937IGHV2-50loss14106494135106494597-1
ENSG00000211944IGHV3-160loss14106621894106622419-1
ENSG00000211943IGHV3-150loss14106610313106610852-1
ENSG00000254174IGHV1-120loss14106579014106579303-1
ENSG00000254215IGHVIII-11-10loss14106576803106577069-1
ENSG00000211941IGHV3-110loss14106573233106573800-1
ENSG00000252766RNU6-255P0lossY2118086921180973-1
ENSG00000252948RNU6-1314P0lossY28507136285072391
ENSG00000231988OFD1P3Y0lossY889863589080291
ENSG00000233699TTTY180lossY85514118551919-1
ENSG00000238073RBMY2HP0lossY75397847544065-1
ENSG000002245180lossY17053626170545951
ENSG00000234950RBMY2OP0lossY978916297970321
ENSG00000157828RPS4Y20lossY22918050229429181
ENSG00000253578IGKV1-220loss28947025989470696-1
ENSG00000211598IGKV4-10loss289184913891856691
ENSG00000211674IGLJ10loss2223235872232359981
ENSG00000254709IGLL50loss2223229960232382871
ENSG000002078320loss2223198720231988131
ENSG00000253448IGLV3-60loss2223192550231927991
ENSG000002313920loss2223117022231171841
ENSG00000232235CDY3P0lossY90036949005311-1
ENSG00000232348LINC002790lossY850633585128831
ENSG00000225520TTTY160lossY75673987569288-1
ENSG00000224989FAM41AY10lossY19612838196268981
ENSG00000228518SURF6P10lossY19304706193055321
ENSG00000243040RBMY2FP0lossY24455006244679721
ENSG000002297250lossY24017478240196971
ENSG00000169849TSPY14P0lossY23630044236325691
ENSG00000183146CYorf170lossY2354484023548246-1
ENSG00000229551GAPDHP170lossY23023223230242231
ENSG00000252472RNU6-521P0lossY72910957291199-1
ENSG00000253625IGKV2-230loss28947150689472037-1
ENSG00000253732IGKV2-190loss28943445889434740-1
ENSG00000254157IGKV2-180loss28942820789428966-1
ENSG00000240382IGKV1-170loss28941683389417335-1
ENSG00000240864IGKV1-160loss28939935289399854-1
ENSG00000253497IGKV1-130loss28934549289345963-1
ENSG00000240671IGKV1-80loss28929192889292450-1
ENSG00000243466IGKV1-50loss28924681989247475-1
ENSG00000253435IGKV2-40loss28923118489231898-1
ENSG00000211597IGKJ10loss28916139889161435-1
ENSG00000211596IGKJ20loss28916103789161074-1
ENSG00000253963IGLV3-20loss2223215391232156191
ENSG00000211672IGLV4-30loss2223213686232142141
ENSG00000226420IGLV3-40loss2223200200232004431
ENSG00000211671IGLV2-80loss2223165153231657871
ENSG00000211669IGLV3-100loss2223154244231547821
ENSG000002078330loss2223134977231350711
ENSG00000211667IGLV3-120loss2223114317231150791
ENSG000002168440lossY2300514223005596-1
ENSG00000233843CYCSP480lossY28546758285473771
ENSG000002366900lossY755855275607191
ENSG00000236435TSPY12P0lossY75557807557589-1
ENSG00000211592IGKC0loss28915667489157196-1
ENSG00000253202IGKV3-250loss28949198889492240-1
ENSG00000241351IGKV3-110loss28932666889327228-1
ENSG00000225136PGBD4P50loss28922184489222269-1
ENSG00000211593IGKJ50loss28916008089160117-1
ENSG00000253234IGLV2-50loss2223198937231992131
ENSG00000254077IGLV3-70loss2223180779231810491
ENSG000002371270loss2223177041231772931
ENSG00000207836MIR6500loss2223165270231653651
ENSG00000253265IGKV2-140loss28937750689378280-1
ENSG00000197794IGKV7-30loss28921459789214894-1
ENSG00000254029IGLC40loss2223252998232532451
ENSG00000211673IGLV3-10loss2223222886232235761
ENSG00000211670IGLV3-90loss2223161507231622531
ENSG00000198173FAM47C0lossX37026432370297391
ENSG00000253387IGHVIII-5-10loss14106495898106495996-1
ENSG000002252000loss14106444607106445233-1
ENSG00000226555AGKP10lossY16750976167522381
ENSG00000165246NLGN4Y0lossY16634518169575301
ENSG00000226863SHROOM2P10lossY14649708146568181
ENSG00000231159OFD1P8Y0lossY24118460241514961
ENSG000002274440lossY24065082240672531
ENSG00000244395RBMY1D0lossY2402622324040673-1
ENSG00000242389RBMY1E0lossY2402622324064214-1
ENSG00000271123TCEB1P50lossY2379356923793901-1
ENSG000002366150lossY23567656235678811
ENSG00000259247TTTY25P0lossY24476599244786471
ENSG00000226941RBMY1J0lossY24454970245640281
ENSG00000229940TSPY22P0lossY2445207224454098-1
ENSG00000234081TCEB1P100lossY2615305826153384-1
ENSG00000180910TTTY110lossY86513518685423-1
ENSG00000091482SMPX0lossX2172409021776281-1
ENSG000002310690lossX3700359637004166-1
ENSG000002494670lossX36737991367382941
ENSG00000211940IGHV3-90loss14106552285106552809-1
ENSG00000211938IGHV3-70loss14106518400106518932-1
ENSG00000211935IGHV1-30loss14106471246106471723-1
ENSG00000149970CNKSR20lossX21392536216728131
ENSG00000253458IGHVII-15-10loss14106620270106620489-1
ENSG00000253412IGHVIII-13-10loss14106598995106599285-1
ENSG00000238154USP9YP40lossY90272389042220-1
ENSG00000271595TCEB1P350lossY1957675919577094-1
ENSG00000229234RBMY1KP0lossY24355478243627271
ENSG00000230029CDY11P0lossY23858456238601061
ENSG00000237023USP9YP30lossY23823812238358941
ENSG00000215560TTTY50lossY2444294524445023-1
ENSG00000239951IGKV3-200loss28944205789442643-1
ENSG00000244437IGKV3-150loss28938467389385283-1
ENSG00000241755IGKV1-90loss28930947989310012-1
ENSG00000239855IGKV1-60loss28926578189266286-1
ENSG00000211680IGLJ40loss2223252744232527761
ENSG00000211678IGLJ30loss2223247030232472051
ENSG00000211676IGLJ20loss2223241661232418351
ENSG000002264770loss2223157168231574231