Cell Line Synopsis
Cell Line Overview
Mutations
Copy Number Variation
Gene Expression
RNAi
Compound Sensitivity Profile
Similar Cell Lines

CAL-51 - Copy Number Variation - Cell Line Synopsis

External Data Sources:COSMIC - Cell Lines Project
Genome Average Copy Number: 1.99

Regions

Chromosome Genome Start Genome Stop Copy Number Signal
Y964855196961760loss
Y864677088332260loss
Y939219695257450loss
Y27690911277181930loss
Y24349164245340360loss
Y21413265215523230loss
Y28782094287999360loss
Y421769042944500loss
Y21159055212118420loss
Y374373938224080loss
Y14628509147490950loss
Y15926943160325240loss
Y977521298451980loss
Y549574458975450loss
Y783333783733840loss
Y23766155238591640loss
1067308738673144470loss
Y22777463230582020loss
Y889643191310980loss
Y663269567897220loss
Y334081234769720loss
Y14109585143578030loss
839247112393841250loss
11497354449740300loss
Y18166715182890060loss
Y18546248187307590loss
Y18805381191652550loss
Y19205570195706330loss
Y21769434226704910loss
Y23252409236532430loss
Y28049144281026450loss
Y28392699286453680loss
Y14785989158169470loss
Y16222446168211790loss
Y16944937172903460loss
Y17564711179699260loss
Y265043928145610loss
Y407049841815950loss
Y437096245648000loss
Y726327875256400loss
Y757979977820420loss

Genes

Ensembl Gene Gene Name(s) Copy Number Signal Chromosome Start Stop Strand
ENSG00000231436RBMY3AP0lossY94481809458885-1
ENSG000001733570lossY877426587841141
ENSG00000184895SRY0lossY26548962655740-1
ENSG00000237546XKRYP60lossY28089415281002991
ENSG00000227635USP9YP210lossY2807998028082028-1
ENSG00000229416USP9YP80lossY2383913223843004-1
ENSG00000223637RBMY2EP0lossY2355687723563471-1
ENSG000002269180lossY23473154234807811
ENSG00000224482HSFY4P0lossY2297066222973695-1
ENSG00000225624TBL1YP10lossY22889140229047861
ENSG000002601970lossY2185382721856492-1
ENSG00000234529GAPDHP190lossY21489455214904591
ENSG000002662200lossY1636406516364171-1
ENSG000002526940lossY1577984015779936-1
ENSG00000183878UTY0lossY1536025915592553-1
ENSG00000235462TAB3P10lossY1526584215274125-1
ENSG00000233774MED14P10lossY1473091514746333-1
ENSG00000197475ADAM3A0loss83930856439380371-1
ENSG00000234110TSPY25P0lossY946179294639611
ENSG00000232924TCEB1P40lossY906852490688561
ENSG00000224408USP9YP220lossY902130390234121
ENSG00000244246ZNF736P8Y0lossY77814637782131-1
ENSG000002282070lossY87692448771317-1
ENSG00000234795RFTN1P10lossY75810267677302-1
ENSG00000216777PRRC2CP10lossY34176933417851-1
ENSG00000232195TOMM22P20lossY269602326962591
ENSG00000188399ANKRD36P10lossY28555962285666821
ENSG00000252625RNU1-40P0lossY28075126280752891
ENSG00000226042CDY10P0lossY2379936123800927-1
ENSG000002357190lossY2362727023629049-1
ENSG00000237269RBMY2TP0lossY2359258323599131-1
ENSG00000012817KDM5D0lossY2186575121906825-1
ENSG00000227949CYCSP460lossY1705342717053630-1
ENSG000002235170lossY1638809216389369-1
ENSG00000228411CDY4P0lossY1491390614915763-1
ENSG00000234950RBMY2OP0lossY978916297970321
ENSG00000229208RBMY2NP0lossY96690279684305-1
ENSG000002283790lossY965092496551221
ENSG00000226223TSPY16P0lossY94778589478325-1
ENSG00000231988OFD1P3Y0lossY889863589080291
ENSG00000234850MTND2P30lossY824028282407511
ENSG00000233634GOT2P50lossY670574867062931
ENSG00000237659RNASEH2CP10lossY265786826583691
ENSG00000252948RNU6-1314P0lossY28507136285072391
ENSG00000232914TRAPPC2P40lossY28050665280533971
ENSG00000237823CDY19P0lossY2771026927712180-1
ENSG00000157828RPS4Y20lossY22918050229429181
ENSG00000228764ZNF885P0lossY22551937225586821
ENSG00000252766RNU6-255P0lossY2118086921180973-1
ENSG000002245180lossY17053626170545951
ENSG00000228518SURF6P10lossY19304706193055321
ENSG00000154620TMSB4Y0lossY15815447158179041
ENSG00000215414PSMA6P10lossY15398518153992581
ENSG00000067048DDX3Y0lossY15016019150323901
ENSG00000114374USP9Y0lossY14813160149727641
ENSG000002326170lossY950283895066191
ENSG00000232235CDY3P0lossY90036949005311-1
ENSG00000216824ZNF736P10Y0lossY82868328287941-1
ENSG00000224634ZNF736P6Y0lossY821897282201841
ENSG00000239893ZNF736P9Y0lossY79369377938764-1
ENSG00000241200ZNF736P7Y0lossY78590287859847-1
ENSG00000252472RNU6-521P0lossY72910957291199-1
ENSG00000237701ATP5JP10lossY676879467694131
ENSG00000099721AMELY0lossY67339596742068-1
ENSG000002518790lossY574228757423791
ENSG00000235175RPL26P370lossY56613415661778-1
ENSG00000176679TGIF2LY0lossY344708234480821
ENSG00000229163NAP1L1P20lossY27970422799161-1
ENSG000002517960lossY28393531283936681
ENSG00000230854USP9YP200lossY28069535280759731
ENSG00000223655RAB9AP30lossY2806447028065042-1
ENSG00000243040RBMY2FP0lossY24455006244679721
ENSG00000169849TSPY14P0lossY23630044236325691
ENSG00000183146CYorf170lossY2354484023548246-1
ENSG00000229551GAPDHP170lossY23023223230242231
ENSG00000232522ZNF886P0lossY2216307122174090-1
ENSG00000237997RCC2P20lossY2214846122149738-1
ENSG00000227166STSP10lossY17659096177052111
ENSG00000224035SFPQP10lossY15195704152077191
ENSG00000226529MTND1P10lossY823970482400711
ENSG00000225809RBMY2KP0lossY81324908145229-1
ENSG00000215603ZNF92P1Y0lossY77217277722917-1
ENSG00000237048TTTY120lossY767296576787241
ENSG00000092377TBL1Y0lossY677872769597241
ENSG00000067646ZFY0lossY280311228505471
ENSG00000233843CYCSP480lossY28546758285473771
ENSG000002168440lossY2300514223005596-1
ENSG00000229236TTTY100lossY2262755422681114-1
ENSG000002526890lossY1825012818250259-1
ENSG00000259247TTTY25P0lossY24476599244786471
ENSG00000226941RBMY1J0lossY24454970245640281
ENSG00000229940TSPY22P0lossY2445207224454098-1
ENSG00000271123TCEB1P50lossY2379356923793901-1
ENSG000002366150lossY23567656235678811
ENSG00000226555AGKP10lossY16750976167522381
ENSG00000165246NLGN4Y0lossY16634518169575301
ENSG000002692910lossY15418467154291811
ENSG00000234059CASKP10lossY1504207515060090-1
ENSG00000226863SHROOM2P10lossY14649708146568181
ENSG00000180910TTTY110lossY86513518685423-1
ENSG00000227830TRIM60P3Y0lossY82810788282095-1
ENSG00000215601TSPY24P0lossY814823981502501
ENSG00000215560TTTY50lossY2444294524445023-1
ENSG00000229234RBMY1KP0lossY24355478243627271
ENSG00000230029CDY11P0lossY23858456238601061
ENSG00000237023USP9YP30lossY23823812238358941
ENSG00000232634NEFLP10lossY2338299223383975-1
ENSG00000237427TOMM22P10lossY23292756232930671
ENSG000002526640lossY18174646181747091
ENSG00000236131MED13P10lossY17019778170199481
ENSG00000223915DPPA2P10lossY15342765153433201
ENSG00000238154USP9YP40lossY90272389042220-1
ENSG00000234179MTCYBP10lossY823207382331911
ENSG00000223955MTND6P10lossY82315778232000-1
ENSG00000227204RBMY2JP0lossY799517180122441
ENSG00000227289HSFY3P0lossY27497242751693-1
ENSG00000129824RPS4Y10lossY270952728000411
ENSG00000251841RNU6-1334P0lossY265279026528941
ENSG00000229238PPP1R12BP10lossY2842407028500565-1